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体外转录产量:十万条文库测过,留出相关 0.94
启动子旁序列怎么改体外转录产量,用十万条并行测过。卷积网上留出集相关 0.94。未另开一轮湿实验验证模型新挑的序列。
体外转录产量卡着 mRNA 放大。启动子旁的 DNA 怎么改产量,一直测得不密。Zheng、Hong、Wang 等人用十万条随机寡核苷酸并行测 DNA 和 RNA 丰度(Illumina),再拿卷积神经网络拟合序列到产量。留出集上,预测和实测产量的 Pearson 相关是 0.94。
这是高通量测过的文库,不是又一篇只训公开库的生成模型。摘要写模型可在生产里给新序列打分;没有另开一轮体外转录,去验证模型新挑出来的序列。预印本,未经同行评审。
AI 生成
出处
- Zheng et al., arXiv:2608.23722 · 2608.23722